1993年8月 自治区文化厅拨款1.1万元，由银南行署文物管理所组织对内府墙进行抢险修缮。滑塌府墙就地取同类黄土补平，凹陷墙基除去皮土，以石料填垫，用黄泥覆盖。墙上多处漏洞全部用三合土回填夯实。

1994年3月 自治区文化厅文物处与银南地区文管所共筹集资金3万多元，清挖董府环内府墙外排水沟。东南两面排水沟以石料砌护，西北两面对自然沟渠进行了清挖，四面贯通，并在内府墙东门前建简易石板桥一座。

2000年8月 国家文物局划拨维修费40万元，在自治区、吴忠市文化和文物部门直接领导下组织施工，历时一年，于2001年完工，对董府府墙的墙基、墙面、女儿墙、墙顶面、上墙马道进行修复。

2006年11月 自治区文物局委托甘肃省文物保护维修研究所对董府古建筑进行全面勘察。

2007年3月 完成《宁夏吴忠市董府保护修缮工程方案》。

2007年8月 国家文物局批准《宁夏回族自治区董府保护规划》立项。

2008年3月 国家文物局批准《宁夏回族自治区吴忠市董府文物保护总体规划》。

2008年11月 国家文物局批复同意《全国重点文物保护单位董府修缮设计方案》。

2009年2月 自治区文化厅以宁文发〔2009〕51号文件通知成立董府维修领导小组，自治区文化厅厅长杨玉经和吴忠市市长吴玉才任组长，文化厅副厅长陶雨芳、吴忠市副市长李卫宁、自治区文物局局长陈坤任副组长，下设办公室，陶雨芳任办公室主任，自治区文物局副局长沈子龙、吴忠市文化体育广电局局长张铭生任办公室副主任。

2009年3月 宁夏建设工程招投标管理中心发布《宁夏回族自治区吴忠市董府抢险修缮保护工程》招标公告。

2009年4月23日 北京同兴古建筑工程有限责任公司中标。

2009年5月 自治区文物保护中心与北京同兴古建筑工程有限责任公司签订宁夏吴忠市董府抢险修缮保护工程施工合同、与银川市鸿利建设工程咨询有限公司签订宁夏吴忠市董府抢险修缮保护工程监理合同。

2009年5月下旬 宁夏吴忠市董府抢险修缮保护工程开工仪式在董府举行，自治区文化厅副厅长陶雨芳，吴忠市委常委、宣传部部长赵利宁，吴忠市人大常委会副主任杜灵娅，吴忠市政协副主席刘占保，自治区文物局局长陈坤以及吴忠市文化体育广电局、吴忠市文物管理所、施工方、设计方、监理方代表参加了开工仪式，自治区文化厅副厅长陶雨芳宣布董府抢险修缮保护工程开工。

2011年11月 吴忠市人民政府办公室以吴政办发〔2011〕15v8v/gpa9m+2yvX5YfBLDACH5lMS4dbz8YDqolHIU68o=7号文件通知成立董府维修工作领导小组，副市长马和清任组长，市政府办公室主任丁玉山、市文化体育广电局局长张铭生任副组长。

2012年6月 吴忠市文化体育广电局与施工方——北京同兴古建筑工程有限责任公司就董府修缮工程相关事宜签订补充协议，进一步明确双方责权。

2013年7月23日 吴忠市副市长马和清到董府调研工程进展情况。

2013年7月25日 国家文物局局长励小捷在吴忠市委书记赵永清、自治区文化厅副厅长卫忠陪同下，调研董府文物保护修缮进展及开发利用情况。

2013年8月12日 中国文化遗产研究院付清远教授、北京建工建筑设计研究院汤羽扬教授一行检查、指导董府修缮保护工程施工。

2013年10月23日 自治区政协副主席洪洋在自治区文化厅副厅长卫忠陪同下，调研董府文物保护修缮工作。

2014年8月 董府修缮保护工程竣工，完成门楼、府墙、内院等修缮工程，施工方北京同兴古建筑工程有限责任公司组织自验，各项指标均符合古建筑维修和设计内容要求，向建设方提出竣工验收申请。

2014年9月 吴忠市文化体育新闻出版广电局组织市发改委、建设、规划等相关部门对董府修缮工程进行了初验：董府修缮工程符合设计图纸、变更及洽商的内容，各分部验收达到国家施工验收规范的标准，符合竣工条件。

2015年10月20日 自治区文物局组织专家组对董府抢救性修缮工程进行验收。